张弓
学院: 生命科学技术学院
性别:
职称研究员   博导
学历博士研究生
学位: 博士
电子邮件: zhanggong@jnu.edu.cn
学习经历:
1998-2001 武汉大学国家生物学人才培养基地
2003-2005 德国汉堡科技大学(TU Hamburg-Harburg) 生物技术(生化工程)硕士学位
2005-2008 德国马克思-普朗克研究员生物化学所(Max-Planck Institut für Biochemie) 攻读博士学位
2008-2009 随导师搬迁至德国波茨坦大学(Universit?t Potsdam),获博士学位。博士论文与答辩获得德国最高成绩(summa cum laude,最高荣誉)。
工作经历:
2004-2005 Evotec Technologies 德国汉堡
应用计算器视觉、人工智能技术、仿生学技术,研发高通量药物筛选系统的样品全自动分析模块(单系统 >10万样品/天),客户包括德国Fraunhofer研究院、美国斯坦福大学等。
2009-2011 德国波茨坦大学 博士后研究
2010 伦敦大学学院(University College London) 访问学者
2011至今  暨南大学
研究方向:
生化与分子生物学(研究重点:翻译组学与翻译控制)、生物信息学
主要论文:
Zhang, G., Hubalewska, M., & Ignatova, Z.*, Transient ribosomal attenuation coordinates protein synthesis and co-translational folding. Nature Structural and Molecular Biology, 16(3):274-80 (2009). 
Zhang, G., & Ignatova, Z.*, A generic algorithm to predict the speed of translational elongation: implications for protein biogenesis. PLoS One, 4(4):e5036 (2009).
Zhang, G., Fedyunin, I., Miekley, O., Valleriani, A., Moura A. & Ignatova, Z.*, Global and local depletion of ternary complex limits translational elongation. Nucleic Acid Res, (2010) 38(14):4778-87
Zhang, G. & Ignatova, Z.*, Folding at the birth of the nascent chain: Coordinating translation with co-translational folding. Current Opinion of Structural Biology, (2011) 21:25-31.
Zhang, G., Lukoszek, R., Mueller-Roeber, B., Ignatova, Z.*, Different sequence signatures in the upstream regions of plant and animal tRNA genes shape distinct modes of regulation. Nucleic Acid Res. (2011) 39(8):3331-9
Zhang, G.*, Fedyunin, I., Kirchner, S., Xiao, C., Valleriani, A. & Ignatova, Z.*, FANSe: an accurate algorithm for quantitative mapping of large scale sequencing reads. Nucleic Acid Res. 40 (11): e83 (2012) 
Fedyunin I, Lehnhardt L, B?hmer N, Kaufmann P, Zhang G, Ignatova Z*. tRNA concentration fine tunes protein solubility. FEBS Lett. 21;586(19):3336-40 (2012)
Xiao CL, Chen XZ, Du YL, Sun X, Zhang G *, He QY *. Binomial probability distribution model-based protein identification algorithm for tandem mass spectrometry utilizing peak intensity information. J Proteome Res. 12(1):328-35 (2013)
Wang T *, Cui Y, Jin J, Guo J, Wang G, Yin X, He QY *, Zhang G*. Translating mRNAs strongly correlate to proteins in a multivariate manner and their translation ratios are phenotype-specific. Nucleic Acids Res (2013)  41 (9): 4743-4754. 
Xiao CL, Chen XZ, Du YL, Li ZF, Wei L, Zhang G*, He QY*. Dispec: a novel Peptide scoring algorithm based on Peptide matching discriminability. PLoS ONE (2013) 8(5):e62724 
承担课题:
2012年教育部重点项目:细胞进行异源蛋白质表达时的tRNA组变化
2012年教育部博士点项目:结直肠癌体外肿瘤微环境中细胞间传递的核酸信息及其对靶细胞翻译组的影响
所授课程:
【研究生课程】生物信息学导论
【研究生课程】功能蛋白质研究
【本科生课程】国际学院 细胞生物学(全英授课)
【本科生课程】生物信息学
社会职务:
国际德尔斐艺术委员会(International Delphic Council)顾问
中国人类蛋白质组学计划研究骨干成员
PNAS, Bioinformatics等期刊通讯审稿人
国家自然科学基金委项目通讯评审专家
广东省“千百十工程”省级培养对象
广东省企业科技特派员
荣誉与奖励:
2005-2008年,获德国KAAD奖学金
2010年,获德国Michelson-Preis最佳博士生大奖,成为第一位获得此荣誉的华人
简介:

 张弓博士,研究生导师,博士毕业于德国波茨坦大学,获德国Michelson-Preis最佳博士生奖。现为暨南大学翻译组学实验室负责人。国家优秀青年基金获得者,国家863青年科学家,国家万人计划“青年拔尖人才”,广东省科技特派员,国际人类蛋白质组计划中国团队骨干研究成员,中国生化与分子生物学学会蛋白质组学专业委员会(CNHUPO)理事,获美国化学学会颁发的会员奖。主要研究领域是翻译组学、生物信息学与系统生物学。目前讲授《生物信息学》、《音乐欣赏》课程。 
   发现翻译速率调控是决定蛋白质折叠的关键因素之一,对1972年诺贝尔化学奖理论“安芬森原则”作出重要更新。首次实现高等生物翻译中mRNA全长测序,揭示了翻译调控在生物信息传递中的关键地位,建立了翻译中mRNA与蛋白质丰度之间的定量关系,将中心法则定量化。由此建立翻译组学新领域,翻译组分析被作为国际人类蛋白质组计划(HPP)的关键支柱之一,被HUPO列为2014年首要突出贡献;2014年作为中国蛋白质组学学会唯一代表被HUPO邀请在HUPO世界大会上做翻译组学专题报告。研发FANSe系列超高精度大规模测序序列比对算法,是目前精度最高的算法,有效解决大规模测序的可验证性、可重复性问题。首次实现tRNA组全定量测定,发现细菌不依赖任何基因突变即可耐受几乎所有抗生素的翻译组全局调控机制。在应用领域,发明翻译暂停理性重设计法优化蛋白质可溶性表达效率,可在氨基酸序列、表达条件完全不变的前提下,将蛋白质可溶性表达产率提高数千倍,为生化工程提供全新的可能性。为川崎病等未知病因的疾病寻找可靠的分子标志物。
   张弓教授在Nature系列、Nucleic Acids Research, PLoS Genetics等国际知名期刊上共发表30余篇SCI论文,获得2项国家发明专利。2015年其指导的高中生在Molecular Biosystems杂志上发表研究论文并被作为当期封面文章,是中国高中生在生物类SCI杂志上发表的第一篇研究论文。 

 

 

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